出现扁桃体结石的主要原因是因为扁桃体炎的反复发作，引起隐窝口明显纤维化与引流受阻，进入扁桃体隐窝的食物残渣、坏死的细菌、炎性细胞以及脱落的上皮混合到一起形成了结石。

扁桃体结石的主要症状是咽部有异物感，结石变大以后会压迫扁桃体组织，产生异物感，而积聚时间长的扁桃体结石，会发酵、霉变从而产生臭味，出现口臭的 症状，影响患者生活与工作。